L'une des principales réalisations de la foodomique est le profilage complet de la composition des aliments. Les aliments ne sont pas seulement des sources de macronutriments, mais des matrices complexes contenant des milliers de composés bioactifs et de métabolites. Ce profil chimique complet est connu sous le nom de métabolome alimentaire.

Une avancée majeure a été l'identification de biomarqueurs alimentaires. Lorsque nous consommons de la nourriture, le profil métabolique de notre corps change en réponse. La recherche en foodomique peut détecter ces changements subtils, identifiant des molécules spécifiques dans le sang ou l'urine qui servent d'indicateurs objectifs de l'apport alimentaire.

Le concept selon lequel les individus réagissent différemment au même régime est au cœur de la nutrigénomique, un composant clé de la foodomique. La recherche montre que notre constitution génétique influence considérablement la façon dont nous métabolisons les nutriments. Certaines variantes génétiques peuvent affecter notre risque de développer des conditions liées à l'alimentation, comme l'obésité ou un taux de cholestérol élevé.

L'application ultime de ces découvertes est le développement de la nutrition personnalisée. En intégrant les informations génétiques d'un individu, son profil métabolique et les données de son microbiome intestinal, la foodomique vise à créer des plans alimentaires hautement personnalisés. Cela représente un changement de paradigme, passant des conseils basés sur la population à la nutrition de précision.

Le volume considérable et l'hétérogénéité des données générées par les différentes plateformes omiques représentent un défi de taille. L'intégration des ensembles de données de génomique, de protéomique et de métabolomique en un modèle biologique unique et cohérent est gourmande en ressources informatiques et nécessite une expertise sophistiquée en bio-informatique. Donner un sens à ces interactions complexes est un goulot d'étranglement majeur.

Les instruments analytiques de pointe requis pour la recherche en foodomique sont extrêmement coûteux à acquérir, à exploiter et à entretenir. Ce coût élevé limite le nombre de laboratoires pouvant effectuer ce type de recherche, ce qui ralentit potentiellement les progrès et crée des disparités dans l'avancement scientifique à l'échelle mondiale.

Un manque de protocoles standardisés entre les différentes études rend difficile la comparaison et la reproduction des résultats. L'établissement de méthodes uniformes pour la collecte d'échantillons, l'acquisition de données et l'analyse statistique est essentiel pour construire un corpus de preuves robuste et fiable. De plus, de nombreux biomarqueurs potentiels découverts grâce à la foodomique nécessitent une validation approfondie dans des études humaines à grande échelle avant de pouvoir être appliqués en milieu clinique.